LP_OKM_GEN
	Pracovní příručky/Kompletní pracovní příručka
	číslo dokumentu	: OKM_VYS_1_23
	verze dokumentu	: 01
	platí od	: 03.06.2017
	sestaveno	: 16.04.2021

Centrální laboratoře Fakultní nemocnice Bulovka, Budínova 67/2, 180 81 Praha 8

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE Průkaz DNA / RNA (PCR)

Herpetické infekce (krev / mok / stěr / plodová voda / jiné)	HSV T1, HSV T2 CMV - CMV kvantitativně VZV EBV (EDTA krev! )
Respirační infekce (výtěr / BAL / výplach / mok / sputum)	Influenza A, Influenza A – typizace, Influenza B Adenovirus PCR PIV – virus parainfluenzy Aspergillus PCR Panel respiračních infekcí (z výtěru) – multiplex PCR (Adenovirus DNA, Coronavirus 229E RNA, Coronavirus HKU1 RNA, Coronavirus NL63 RNA, oronavirus OC43 RNA, MERS-CoV RNA, SARS CoV-2 RNA, Metapneumovirus RNA, Rhinovirus / Enterovirus RNA, Influenza A RNA, Influenza B RNA, Parainfluenza virus 1 RNA, Parainfluenza virus 2 RNA, Parainfluenza virus 3 RNA, Parainfluenza virus 4 RNA, RSV RNA, Bordetella pertusis, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae) COVID-19 PCR RSV (respirační syncycyální virus) PCR Panel CAP (komunitní pneumonie) (Streptococcus pneumoniae, Hemophillus influenze, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis) Bordetella pertussis a parapertussis - PCR Mycobacterium TBC komplex Mycobacterium sp. Pneumocystóza mikr a PCR PAR
Dětské exantémové nemoci	Morbilli PCR Parvovirus B19 PCR Parotitis PCR
Virové hepatitidy	HBV kvantitativně HCV kvantitativně, Genotypizace HCV HEV PCR (sérum, stolice)
Neuroinfekce (krev / mozkomíšní mok)	Panel bakteriálních meningitid (mok) - PCR multiplex (Haemophilus influenza, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus agalactiae, Listeria monocytogenes, E. coli) Panel virových meningitid - PCR multiplex (HSV-1 / HSV -2 / VZV) Enteroviry PCR (mozkomíšní mok,…) Polyomavirus JCV PCR (mozkomíšní mok,…) Polyomavirus BKV PCR (moč,…) Virus západonilské horečky (WNV) PCR Borrelia - PCR PAME - Primární amébová meningoencefalitida GAE - Granulomatózní encefalitida
Pohlavně přenosné infekce (stěr, výtěr, sekret, moč)	Chlamydia trachomatis PCR Neisseria gonorrhoeae PCR HPV (LR / HR typy) z cervixu Trichomonas vaginalis Panel STI - PCR multiplex (Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Trichomonas vaginalis) Panel uregonitální vřed – multiplex PCR (Treponema pallidum, Haemophilus ducreyi, LGV, Herpes simplex virus 1, 2, Varicella zoster virus, Cytomegalovirus)
Infekce cestovatelů	Dengue PCR Chickungunya PCR Zika Panel stolice na parazity - PCR multiplex (Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium, sp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis)
Parazitární infekce	Pneumocystóza mikr a PCR PAR PAME - Primární amébová meningoencefalitida GAE - Granulomatózní encefalitida Leishmanióza - mikroskopie + PCR Trichomonas vaginalis Panel stolice na parazity - PCR multiplex (Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium, sp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis) Panel helmintóz - PCR multiplex (Enterocytozoon spp./Encephalitozoon spp., Strongyloides spp., Hymenolepis spp., Ascaris spp., Taenia spp., Trichuris trichiura spp., Ancylostoma spp., Enterobius vermicularis , Necator americanus)
Jiné	Clostridium difficile Borrelia - PCR (synoviální tekutina) Komplexní vyš. stolice před fekální transplantací – PCR multiplex